Programme
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événement |
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09:00 - 10:45
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Ateliers |
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10:00 - 10:45
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Accueil des participant.e.s - distribution des badges, QR codes pour accès campus, et codes wifi |
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11:00 - 11:15
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Introduction aux journées - Stéphane Dray & Olivier Gimenez |
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11:15 - 12:00
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Communautés, biodiversité et macro-écologie - Sarah Bauduin |
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11:15 - 11:25 |
› Biotic interactions in breeding bird communities drive nonlinear responses to global changes - Pierre Gaüzère, Laboratoire dÉcologie Alpine |
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11:26 - 11:36 |
› Manipulation et représentation de méta-réseaux trophiques avec 'metanetwork' - Marc Ohlmann - Laboratoire dÉcologie Alpine |
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11:37 - 11:47 |
› Modélisation de la structure d'une matrice de distances entre séquences avec un SBM pour caractériser la diversité - Nathalie Peyrard - MIAT- INRAE |
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11:48 - 11:58 |
› Evaluation de la qualité des OTUs produits par metabarcoding - Alain Franc - UMR BIODIVERSITE GENES COMMUNAUTES |
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12:00 - 12:45
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Biodémographie évolutive et dynamique des populations - Thibaut Couturier |
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12:00 - 12:10 |
› Small Population Management : A bayesian version of Galton-Watson for population growth and its use in the management of small population - Bénédicte Fontez, UMR Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA) |
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12:11 - 12:21 |
› Spatially balanced sampling methods are always more precise than random ones for estimating the size of aggregated populations |
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12:22 - 12:32 |
› Mise en forme et contrôle qualité des données, lorsque l'informatique se met au service de l'écologie - Floren HUGON, CNRS/Univ Pau & Pays Adour, Laboratoire de Mathématiques et de leurs Applications de Pau - Fédération MIRA, UMR 5142, 64600 Anglet, France |
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12:33 - 12:43 |
› Modélisation des erreurs d'identification en capture recapture - Rémi Fraysse - CEFE |
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12:45 - 14:30
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Déjeuner |
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14:30 - 15:30
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Eco-épidémiologie - Sarah Cubaynes |
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14:30 - 14:40 |
› Capturing Complex Interactions in Disease Ecology with Simplicial Sets - Matthew Silk, CEFE, University of Montpellier, CNRS, EPHE, IRD, University of Paul Valéry Montpellier 3, Montpellier, France |
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14:41 - 14:51 |
› trajeR, an R package for cluster analysis of time series - Cédric NOEL, IUT de Thionville-Yutz,, Faculty of Science, Technology and Medicine |
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14:52 - 15:02 |
› Modélisation et inférence statistique appliquées à l'épidémiologie évolutive des maladies infectieuses - Wakinyan Benhamou, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE) - UMR 5175 |
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14:30 - 15:30
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Ecologie du déplacement - Aurélien Besnard |
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15:03 - 15:13 |
› A model to predict resource discovery by Central Place Foragers - Ana Moran, Research Center on Animal Cognition, Center for Integrative Biology, |
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15:14 - 15:24 |
› Estimer correctement la sélection de l'habitat en présence de contraintes spatiales - Simon Benhamou, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive |
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15:30 - 16:00
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Pause |
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16:00 - 17:00
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Ecologie du déplacement - Olivier Gimenez |
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16:00 - 16:10 |
› The role of individual variability on the predictive performance of machine learning applied to large bio-logging datasets. - Marianna Chimienti, Centre d'Etudes Biologiques de Chizé, UMR7372 CNRS - La Rochelle Université, 405 Route de Prissé la Charrière, 79360 Villiers-en-Bois |
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16:00 - 17:00
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Gestion des ressources renouvelables - Olivier Gimenez |
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16:11 - 16:21 |
› Classification automatique d'images de biocolonisation sur des structures d'énergies marines renouvelables utilisant un réseau de neurone à convolution. - Juliette SIGNOR, Institut de Recherche en Génie Civil et Mécanique (GeM), France Energies Marines |
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16:22 - 16:32 |
› L'identification et la classification de signaux acoustiques par intelligence artificielle : réponse comportementale de dauphins communs aux signaux émis par une balise acoustique bio-inspirée pour limiter leur capture accidentelle - Loïc LEHNHOFF, Laboratoire dÍnformatique et Systèmes, MARine Biodiversity Exploitation and Conservation |
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16:33 - 16:43 |
› Inférer la distribution des espèces à l'aide de données de captures spatialement agrégées - Baptiste Alglave, Unité EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) |
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16:00 - 17:00
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Sciences participatives - Olivier Gimenez |
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16:44 - 16:54 |
› Quelle place pour les biostatistiques sur Wikipédia ? Retour sur le marathon d'édition de décembre 2021 - Delphine Montagne, Transitions Energétiques et Environnementales |
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17:00 - 17:30
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Discussion sur le futur du GdR - Stéphane Dray |
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19:00 - 23:55
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Banquet |
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événement |
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09:00 - 09:45
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Biodémographie évolutive et dynamique des populations - Aurélien Besnard |
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09:00 - 09:10 |
› Invasion by dandelions in the Kerguelen archipelago explained by autoregressive models - Frederic Barraquand, Institut de Mathématiques de Bordeaux |
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09:11 - 09:21 |
› Quantification de l'hétérogénéité fixe au sein des paramètres démographiques: performances des effets aléatoires corrélés pour les variables suivant une distribution de Bernoulli - Rémi Fay, NTNU Norway |
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09:22 - 09:32 |
› Des modèles de capture-recapture « multi-stratégies », le cas des différentes stratégies migratoires du Flamant rose en Camargue - Sébastien Roques, Institut de recherche de la Tour du Valat |
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09:33 - 09:43 |
› Machine learning appraoch for Desert locust monitoring and preventive management - Lucile Marescot, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations |
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09:45 - 10:30
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Table ronde "Pourquoi des statistiques en appui aux politiques publiques dans la gestion de la biodiversité?" - Karine Princé, Isabelle Witté, Jean-Marc Fromentin, Matthieu Authier (Olivier Gimenez) |
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10:30 - 11:00
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Pause |
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11:00 - 11:45
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Communautés, biodiversité et macro-écologie - Wilfried Thuiller |
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11:00 - 11:10 |
› Décrire un pattern journalier: mise en place de régressions linéaires mixtes par segmentation - Ugoline Godeau, Abeilles et Environnement |
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11:11 - 11:21 |
› DeepFaune : une initiative collaborative pour développer un modèle de reconnaissance de la faune française dans les images de pièges photographiques - Noa Rigoudy, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive |
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11:22 - 11:32 |
› A deep learning algorithm to identify invasive marine fishes in underwater images. - Valentine Fleuré, UMR MARBEC |
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11:33 - 11:43 |
› Distance sampling : utilisation des effets fusion pour regrouper automatiquement les espèces avec des probabilités de détection similaires - Floriane Plard, Observatoire Pelagis, |
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11:45 - 12:30
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Communautés, biodiversité et macro-écologie - Maëlis Kervellec |
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11:45 - 11:55 |
› A new quantitative genetic model raking into account imperfect detection to measure heritability of dispersal in the wild - Patrizia Zamberletti, Biostatistique et Processus Spatiaux |
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11:56 - 12:06 |
› Deep-SDMs à partir de séries temporelles d'images Sentinel-2: Une analyse à l'échelle mondiale sur la famille des orchidées - Joaquim Estopinan, ZENITH |
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12:07 - 12:17 |
› A Comparison of Deep Learning Architectures for Inferring Speciation and Extinction Rates from Extant Phylogenies - Ismaël Lajaaiti, ISEM |
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12:18 - 12:28 |
› Extension of linear mixture models to multilevel nested random effects for modeling trees growth in high diverse tropical forest. - Fabrice MOUDJIEU, Laboratoire d'ingénierie mathématique et des systèmes d'information, Ecole Polytechnique de Yaoundé, CIRAD Forêt et Société, IMAG |
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12:30 - 14:30
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Déjeuner |
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14:30 - 15:15
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Communautés, biodiversité et macro-écologie - Vincent Miele |
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14:30 - 14:40 |
› Calibrer les modèles de communautés avec des données de traits fonctionnels - Loïc Chalmandrier, Université de Regensburg |
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14:41 - 14:51 |
› Explicitly integrating trophic interactions in species distribution models improves ecological niche estimations and predictions - Giovanni Poggiato - Laboratoire dÉcologie Alpine |
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14:52 - 15:02 |
› Improving ecological clustering with UMAP and HDBSCAN: an application to the Reef Life Survey datasets - Clément VIOLET, IFREMER, Centre de Bretagne, DYNECO LEBCO, 29280 Plouzané, France. |
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15:03 - 15:13 |
› Choux, carottes, biodiversité et structural equation modelling - Guillaume Body, Office français de la biodiversité |
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15:15 - 16:00
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Communautés, biodiversité et macro-écologie - Sonia Kefi |
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15:15 - 15:25 |
› Etude des relations entre isotopes et changements de croissance en mer chez le saumon atlantique (Salmo salar) - Quentin Queiros, DECOD (Ecosystem Dynamics and Sustainability) |
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15:26 - 15:36 |
› Les jeux de données à large-échelle multi-espèces: des outils prometteurs pour explorer les incertitudes des modèles de distribution d'espèces joints (jSDM) - Clément Vallé, CESCO |
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15:37 - 15:47 |
› Un modèle nul générique pour les réseaux écologiques - Tâm Le Minh, MIA-Paris |
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15:48 - 15:58 |
› Determining abundance-environment relationships of manila clam using misaligned environmental data - Bastien Mourguiart, Laboratoire de Mathématiques et de leurs Applications [Pau] |
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16:00 - 16:30
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Retour sur les journées - Stéphane Dray & Olivier Gimenez |
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