lundi 4 avril 2022

Heures événement (+)
09:00 - 10:45 Ateliers  
10:00 - 10:45 Accueil des participant.e.s - distribution des badges, QR codes pour accès campus, et codes wifi  
11:00 - 11:15 Introduction aux journées - Stéphane Dray & Olivier Gimenez  
11:15 - 12:00 Communautés, biodiversité et macro-écologie - Sarah Bauduin (+)  
11:15 - 11:25 › Biotic interactions in breeding bird communities drive nonlinear responses to global changes - Pierre Gaüzère, Laboratoire dÉcologie Alpine  
11:26 - 11:36 › Manipulation et représentation de méta-réseaux trophiques avec 'metanetwork' - Marc Ohlmann - Laboratoire dÉcologie Alpine  
11:37 - 11:47 › Modélisation de la structure d'une matrice de distances entre séquences avec un SBM pour caractériser la diversité - Nathalie Peyrard - MIAT- INRAE  
11:48 - 11:58 › Evaluation de la qualité des OTUs produits par metabarcoding - Alain Franc - UMR BIODIVERSITE GENES COMMUNAUTES  
12:00 - 12:45 Biodémographie évolutive et dynamique des populations - Thibaut Couturier (+)  
12:00 - 12:10 › Small Population Management : A bayesian version of Galton-Watson for population growth and its use in the management of small population - Bénédicte Fontez, UMR Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA)  
12:11 - 12:21 › Spatially balanced sampling methods are always more precise than random ones for estimating the size of aggregated populations  
12:22 - 12:32 › Mise en forme et contrôle qualité des données, lorsque l'informatique se met au service de l'écologie - Floren HUGON, CNRS/Univ Pau & Pays Adour, Laboratoire de Mathématiques et de leurs Applications de Pau - Fédération MIRA, UMR 5142, 64600 Anglet, France  
12:33 - 12:43 › Modélisation des erreurs d'identification en capture recapture - Rémi Fraysse - CEFE  
12:45 - 14:30 Déjeuner  
14:30 - 15:30 Eco-épidémiologie - Sarah Cubaynes (+)  
14:30 - 14:40 › Capturing Complex Interactions in Disease Ecology with Simplicial Sets - Matthew Silk, CEFE, University of Montpellier, CNRS, EPHE, IRD, University of Paul Valéry Montpellier 3, Montpellier, France  
14:41 - 14:51 › trajeR, an R package for cluster analysis of time series - Cédric NOEL, IUT de Thionville-Yutz,, Faculty of Science, Technology and Medicine  
14:52 - 15:02 › Modélisation et inférence statistique appliquées à l'épidémiologie évolutive des maladies infectieuses - Wakinyan Benhamou, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE) - UMR 5175  
14:30 - 15:30 Ecologie du déplacement - Aurélien Besnard (+)  
15:03 - 15:13 › A model to predict resource discovery by Central Place Foragers - Ana Moran, Research Center on Animal Cognition, Center for Integrative Biology,  
15:14 - 15:24 › Estimer correctement la sélection de l'habitat en présence de contraintes spatiales - Simon Benhamou, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive  
15:30 - 16:00 Pause  
16:00 - 17:00 Ecologie du déplacement - Olivier Gimenez (+)  
16:00 - 16:10 › The role of individual variability on the predictive performance of machine learning applied to large bio-logging datasets. - Marianna Chimienti, Centre d'Etudes Biologiques de Chizé, UMR7372 CNRS - La Rochelle Université, 405 Route de Prissé la Charrière, 79360 Villiers-en-Bois  
16:00 - 17:00 Gestion des ressources renouvelables - Olivier Gimenez (+)  
16:11 - 16:21 › Classification automatique d'images de biocolonisation sur des structures d'énergies marines renouvelables utilisant un réseau de neurone à convolution. - Juliette SIGNOR, Institut de Recherche en Génie Civil et Mécanique (GeM), France Energies Marines  
16:22 - 16:32 › L'identification et la classification de signaux acoustiques par intelligence artificielle : réponse comportementale de dauphins communs aux signaux émis par une balise acoustique bio-inspirée pour limiter leur capture accidentelle - Loïc LEHNHOFF, Laboratoire dÍnformatique et Systèmes, MARine Biodiversity Exploitation and Conservation  
16:33 - 16:43 › Inférer la distribution des espèces à l'aide de données de captures spatialement agrégées - Baptiste Alglave, Unité EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique)  
16:00 - 17:00 Sciences participatives - Olivier Gimenez (+)  
16:44 - 16:54 › Quelle place pour les biostatistiques sur Wikipédia ? Retour sur le marathon d'édition de décembre 2021 - Delphine Montagne, Transitions Energétiques et Environnementales  
17:00 - 17:30 Discussion sur le futur du GdR - Stéphane Dray  
19:00 - 23:55 Banquet  

mardi 5 avril 2022

Heures événement (+)
09:00 - 09:45 Biodémographie évolutive et dynamique des populations - Aurélien Besnard (+)  
09:00 - 09:10 › Invasion by dandelions in the Kerguelen archipelago explained by autoregressive models - Frederic Barraquand, Institut de Mathématiques de Bordeaux  
09:11 - 09:21 › Quantification de l'hétérogénéité fixe au sein des paramètres démographiques: performances des effets aléatoires corrélés pour les variables suivant une distribution de Bernoulli - Rémi Fay, NTNU Norway  
09:22 - 09:32 › Des modèles de capture-recapture « multi-stratégies », le cas des différentes stratégies migratoires du Flamant rose en Camargue - Sébastien Roques, Institut de recherche de la Tour du Valat  
09:33 - 09:43 › Machine learning appraoch for Desert locust monitoring and preventive management - Lucile Marescot, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations  
09:45 - 10:30 Table ronde "Pourquoi des statistiques en appui aux politiques publiques dans la gestion de la biodiversité?" - Karine Princé, Isabelle Witté, Jean-Marc Fromentin, Matthieu Authier (Olivier Gimenez)  
10:30 - 11:00 Pause  
11:00 - 11:45 Communautés, biodiversité et macro-écologie - Wilfried Thuiller (+)  
11:00 - 11:10 › Décrire un pattern journalier: mise en place de régressions linéaires mixtes par segmentation - Ugoline Godeau, Abeilles et Environnement  
11:11 - 11:21 › DeepFaune : une initiative collaborative pour développer un modèle de reconnaissance de la faune française dans les images de pièges photographiques - Noa Rigoudy, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive  
11:22 - 11:32 › A deep learning algorithm to identify invasive marine fishes in underwater images. - Valentine Fleuré, UMR MARBEC  
11:33 - 11:43 › Distance sampling : utilisation des effets fusion pour regrouper automatiquement les espèces avec des probabilités de détection similaires - Floriane Plard, Observatoire Pelagis,  
11:45 - 12:30 Communautés, biodiversité et macro-écologie - Maëlis Kervellec (+)  
11:45 - 11:55 › A new quantitative genetic model raking into account imperfect detection to measure heritability of dispersal in the wild - Patrizia Zamberletti, Biostatistique et Processus Spatiaux  
11:56 - 12:06 › Deep-SDMs à partir de séries temporelles d'images Sentinel-2: Une analyse à l'échelle mondiale sur la famille des orchidées - Joaquim Estopinan, ZENITH  
12:07 - 12:17 › A Comparison of Deep Learning Architectures for Inferring Speciation and Extinction Rates from Extant Phylogenies - Ismaël Lajaaiti, ISEM  
12:18 - 12:28 › Extension of linear mixture models to multilevel nested random effects for modeling trees growth in high diverse tropical forest. - Fabrice MOUDJIEU, Laboratoire d'ingénierie mathématique et des systèmes d'information, Ecole Polytechnique de Yaoundé, CIRAD Forêt et Société, IMAG  
12:30 - 14:30 Déjeuner  
14:30 - 15:15 Communautés, biodiversité et macro-écologie - Vincent Miele (+)  
14:30 - 14:40 › Calibrer les modèles de communautés avec des données de traits fonctionnels - Loïc Chalmandrier, Université de Regensburg  
14:41 - 14:51 › Explicitly integrating trophic interactions in species distribution models improves ecological niche estimations and predictions - Giovanni Poggiato - Laboratoire dÉcologie Alpine  
14:52 - 15:02 › Improving ecological clustering with UMAP and HDBSCAN: an application to the Reef Life Survey datasets - Clément VIOLET, IFREMER, Centre de Bretagne, DYNECO LEBCO, 29280 Plouzané, France.  
15:03 - 15:13 › Choux, carottes, biodiversité et structural equation modelling - Guillaume Body, Office français de la biodiversité  
15:15 - 16:00 Communautés, biodiversité et macro-écologie - Sonia Kefi (+)  
15:15 - 15:25 › Etude des relations entre isotopes et changements de croissance en mer chez le saumon atlantique (Salmo salar) - Quentin Queiros, DECOD (Ecosystem Dynamics and Sustainability)  
15:26 - 15:36 › Les jeux de données à large-échelle multi-espèces: des outils prometteurs pour explorer les incertitudes des modèles de distribution d'espèces joints (jSDM) - Clément Vallé, CESCO  
15:37 - 15:47 › Un modèle nul générique pour les réseaux écologiques - Tâm Le Minh, MIA-Paris  
15:48 - 15:58 › Determining abundance-environment relationships of manila clam using misaligned environmental data - Bastien Mourguiart, Laboratoire de Mathématiques et de leurs Applications [Pau]  
16:00 - 16:30 Retour sur les journées - Stéphane Dray & Olivier Gimenez